綜合性
生態農業強調發揮農業生態系統的整體功能，以大農業為出發點，按“整體、協調、循環、再生”的原則，全面規劃，調整和優化農業結構，使農、林、牧、副、漁各業和農村一、二、三產業綜合發展，并使各業之間互相支持，相得益彰，提高綜合生產能力。
多樣性
生態農業針對我國地域遼闊，各地自然條件、資源基礎、經濟與社會發展水平差異較大的情況，充分吸收我國傳統農業精華，結合現代科學技術，以多種生態模式、生態工程和豐富多彩的技術類型裝備農業生產，使各區域都能揚長避短，充分發揮地區優勢，各產業都根據社會需要與當地實際協調發展。
高效性
生態農業通過物質循環和能量多層次綜合利用和系列化深加工，實現經濟增值，實行廢棄物資源化利用，降低農業成本，提高效益，為農村大量剩余勞動力創造農業內部就業機會，保護農民從事農業的積極性。
持續性
發展生態農業能夠保護和改善生態環境，防治污染，維護生態平衡，提高農產品的安全性，變農業和農村經濟的常規發展為持續發展，把環境建設同經濟發展緊密結合起來，在最大限度地滿足人們對農產品日益增長的需求的同時，提高生態系統的穩定性和持續性，增強農業發展后勁。
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